Desde el punto de vista de la sanidad del caballo, un punto importante a tener en cuenta son los vehículos de transporte que se emplean a la hora de sus movimientos. Muchas veces estos vehículos son compartidos entre varios animales y transportan, en numerosas ocasiones, animales enfermos hacia o desde los centros veterinarios. Por tanto, estos vehículos pueden convertirse en foco de enfermedades para los animales a no ser que se adopten las adecuadas medidas higiénicas al respecto. El protocolo de higienización de los vehículos de transporte de los équidos consiste en: